Последующие 30 лет Юрий Алексеевич служил непосредственно в этих войсках: был командир ракетного полка, командиром одной из лучших ракетных дивизий, начальником Северного полигона страны, командующим Смоленской ракетной армией, первым заместителем главнокомандующего Ракетными войсками стратегического назначения.

На всех постах, которые он занимал в РВСН, Юрия Алексеевича отличали компетентность, самопожертвование, умение качественно и продуктивно работать, что позволило ему внести большой вклад в развитие совершенствование систем ракетного вооружения, боевого управления и связи Ракетных войск. Юрий Алексеевич всегда был профессионалом своего дела, генератором прогрессивных идей, большинство из которых сам и реализовал. Многие поколения воинов-ракетчиков гордятся тем, что могут назвать себя его учениками, и стремятся жить и служить, как Яшин. Сам же Юрий Алексеевич всегда руководствовался в жизни словами Сергея Павловича Королева: "Кто хочет работать - ищет средства, кто не хочет - причины".

В 1989 году Юрий Алексеевич назначен председателем Гостехкомиссии СССР - заместителем министра обороны СССР, а в 1992 году - председателем Государственной технической комиссии при Президенте Российской Федерации в ранге министра Российской Федерации. И на всех постах проявился талант руководителя, крупного военачальника, хорошо разбирающегося в современных проблемах развития армии и флота России, способного оперативно решать сложнейшие задачи развития и совершенствования Вооруженных Сил и, в частности, Ракетных войск стратегического назначения.

Отрадно, что и по сей день Юрий Алексеевич сохранил тесные связи с Ракетными войсками, что и сегодня отдает свой жизненный опыт военачальника и научные знания доктора технических наук, профессора делу дальнейшего укрепления Ракетных войск стратегического назначения.